More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6251 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  100 
 
 		 303 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2124  inner-membrane translocator  50.2 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  38.2 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.19 
 
 		 425 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.59 
 
 		 444 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  35.15 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.06 
 
 		 435 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 430 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36.08 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.81 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.24 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0907  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.086185  normal  0.263875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 425 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 428 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4192  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 445 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  30.88 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  31.14 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.14 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  33 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 429 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  33.45 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>