More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1078 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.44 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.44 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.86 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  34.28 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 425 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  30.9 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.67 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  34.98 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.53 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  34.54 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.06 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.45 
 
 		 435 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.33 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  32.18 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.22 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  32.89 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 447 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  33 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  35 
 
 		 430 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 420 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  31 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  31.72 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 440 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>