More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4194 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  100 
 
 		 428 aa  833    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0785  inner-membrane translocator  56.19 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  45.01 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  47.01 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  45.41 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  49.4 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  49.16 
 
 		 435 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 429 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  47.97 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  46.72 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  48.18 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 346 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 309 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 309 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 319 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  41.64 
 
 		 319 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  41.64 
 
 		 319 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 		 319 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 319 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 319 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  40.84 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 319 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.42 
 
 		 318 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.75 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.49 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 321 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 319 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 319 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 286 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 323 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 307 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 308 aa  186  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 323 aa  186  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 310 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.24 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 311 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 301 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  36.48 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  35.4 
 
 		 318 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 324 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  39.22 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  37.67 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.42 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 320 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 317 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  35.83 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 		 310 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.21 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 288 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 311 aa  156  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  33.89 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 308 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>