More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2603 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  64.08 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  47.08 
 
 		 435 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  46 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  46.08 
 
 		 425 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 440 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  44.18 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  44.18 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  42.72 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  42.72 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 445 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  43.18 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  43.88 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  40.78 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.94 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  41.42 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 429 aa  208  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 346 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  42.33 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 430 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  44.78 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  40 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 300 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  38.54 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  38.29 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 428 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  38.89 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.76 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  35.35 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.23 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>