More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1829 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 317 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  98.11 
 
 		 317 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  69.33 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  52.68 
 
 		 317 aa  308  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  53.53 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  52.65 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  52.65 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  52.65 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  52.65 
 
 		 319 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  52.65 
 
 		 319 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  51.99 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  51.1 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  51.99 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  51.66 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  53.02 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  50.78 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  43.79 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  44.87 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  44.12 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  45.07 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  45.96 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  43.67 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 307 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  44 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.69 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  36.59 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.42 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36.78 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  35.98 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.02 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 429 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  36.6 
 
 		 435 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 445 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  32.61 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 440 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 447 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  28.98 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  37.25 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 426 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 426 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  31.49 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 435 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  33.44 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>