More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0039 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 325 aa  622  1e-177  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  40.52 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  40.91 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  39.3 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  40.58 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  36.53 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  37.35 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  36.94 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  33.98 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  31.33 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  31.25 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.49 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  33.86 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 425 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  33.65 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  35.99 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  30.63 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  29.26 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  31 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 440 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 418 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.42 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.07 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>