More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0699 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  100 
 
 
308 aa  590  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
311 aa  215  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  41.97 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.83 
 
 
318 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  35.78 
 
 
318 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
309 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
286 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  35.24 
 
 
318 aa  185  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  36.62 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
319 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
319 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
319 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  35.67 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  35.35 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  37.1 
 
 
318 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  34.45 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  36.18 
 
 
344 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
309 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.83 
 
 
321 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  37.03 
 
 
317 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  34.05 
 
 
317 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
321 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
317 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.01 
 
 
317 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
306 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
346 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.6 
 
 
321 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  34.07 
 
 
420 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
325 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
301 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
305 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
305 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
321 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
321 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
288 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
321 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
346 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
317 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
303 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  30.67 
 
 
425 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
321 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  34.1 
 
 
319 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
288 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  32.81 
 
 
435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.12 
 
 
322 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
322 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  31.03 
 
 
323 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.83 
 
 
423 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  36.72 
 
 
308 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  32.56 
 
 
316 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.53 
 
 
323 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  30.07 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
310 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  31.38 
 
 
429 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
421 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
310 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.79 
 
 
425 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  31.79 
 
 
322 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
447 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  35.38 
 
 
305 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  32.24 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  32.24 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  31.92 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  31.49 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
319 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  29.56 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  29.43 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
310 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
418 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
276 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
310 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
314 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  32.22 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.87 
 
 
323 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  30.62 
 
 
306 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
311 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
315 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>