More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0918 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  100 
 
 
276 aa  544  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  40.29 
 
 
315 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  42.42 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  41.44 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  38.2 
 
 
303 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  38.02 
 
 
307 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  40.15 
 
 
305 aa  188  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  37.98 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  38.78 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
322 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
300 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
309 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
312 aa  168  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2124  inner-membrane translocator  38.04 
 
 
305 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
346 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.38 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.49 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
319 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
309 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  34.84 
 
 
319 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  31.52 
 
 
310 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
346 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
319 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4192  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
306 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
319 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 
319 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.49 
 
 
319 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  34.18 
 
 
288 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
310 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  34.38 
 
 
344 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.13 
 
 
307 aa  155  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  32 
 
 
314 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
425 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
319 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  34.09 
 
 
306 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
298 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
306 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  34.09 
 
 
306 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
425 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
299 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
306 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  34.96 
 
 
306 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
429 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  33.82 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  31.12 
 
 
309 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
303 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
303 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  30.8 
 
 
286 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  33.81 
 
 
321 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  32.95 
 
 
306 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  32.74 
 
 
321 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.83 
 
 
444 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  30.07 
 
 
310 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
321 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  32.75 
 
 
321 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  33.08 
 
 
435 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  32.2 
 
 
306 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  29.14 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  32.59 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.27 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  28.57 
 
 
309 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  30 
 
 
321 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  31.54 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  30.38 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 
308 aa  139  6e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  30.11 
 
 
284 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  30.11 
 
 
284 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
310 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.97 
 
 
305 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
445 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
323 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
325 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  29.85 
 
 
308 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  33.08 
 
 
310 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
420 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  28.99 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  31.54 
 
 
447 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  30.57 
 
 
430 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  32.49 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  28.62 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  30.6 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  29.03 
 
 
323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  28.72 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
306 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  30.25 
 
 
322 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
306 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0121722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>