More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1454 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  100 
 
 		 317 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  67.3 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  65.41 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  65.72 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  63.72 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  52.83 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  53.61 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  52.83 
 
 		 319 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  53.14 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  53.14 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 		 319 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  52.83 
 
 		 319 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 319 aa  331  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  51.89 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  54.23 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  53.62 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  43.81 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  43.67 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  44.77 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.39 
 
 		 425 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 321 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.12 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 346 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.98 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 325 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 440 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.08 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 426 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 429 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 425 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.41 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 293 aa  179  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  37.58 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.29 
 
 		 444 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 420 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>