More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0639 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  74.92 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  48.42 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  45.74 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 319 aa  251  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  45.43 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  45.11 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  45.11 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  44.79 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  44.79 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  45.72 
 
 		 344 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  45.77 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  43.56 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  44.27 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  42.94 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  41.49 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  41.95 
 
 		 425 aa  225  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  41.49 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 286 aa  222  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.73 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  44.77 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  42.64 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.34 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  38.58 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  40 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  40.06 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.74 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  41.99 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.92 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  37.04 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 447 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  40 
 
 		 435 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 440 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.96 
 
 		 435 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  38.08 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 430 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1841  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  34.94 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 429 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1647  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.224801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 420 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 426 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>