More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0298 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  100 
 
 		 312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  46.93 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  44 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  41.59 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  41.9 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  41.59 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  41.9 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  41.59 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  39.3 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  41.89 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  36.5 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  38.15 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.66 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.06 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  41.2 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  37.22 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  35.74 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  36.88 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  37.78 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.59 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  37.42 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 445 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.23 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 447 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 420 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.2 
 
 		 394 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>