More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 394 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  69.57 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  58.05 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  55.81 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  54.76 
 
 		 420 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  49.48 
 
 		 418 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3538  inner-membrane translocator  51.04 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4400  inner-membrane translocator  54.02 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 307 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  32.25 
 
 		 319 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  32.25 
 
 		 319 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 		 319 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 319 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 319 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 286 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 346 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  31.67 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 321 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 321 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.99 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.03 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  31.22 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  33.24 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.41 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 314 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  32.4 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  32 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  31.28 
 
 		 314 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 310 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.5 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.62 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  31.89 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.29 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  35.98 
 
 		 314 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  28.5 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 313 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 315 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.56 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  32 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  34.43 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 310 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  29.46 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 310 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.29 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>