More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4429 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  100 
 
 		 305 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  83.22 
 
 		 307 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  79.93 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  71.84 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  64.24 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  64.74 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  61.09 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  60.45 
 
 		 314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  62.7 
 
 		 314 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  60.13 
 
 		 315 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  61.34 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  60.06 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  59.74 
 
 		 315 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  61.29 
 
 		 313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  63.06 
 
 		 314 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0934  inner-membrane translocator  65.92 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.509235  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4145  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  41.08 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  41.08 
 
 		 326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 445 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.49 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  38.64 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  40 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  38 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  41.03 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  34.39 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.83 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.25 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  40.14 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>