More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2319 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  100 
 
 		 309 aa  597  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  98.38 
 
 		 309 aa  590  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  92.88 
 
 		 309 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  55.23 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  56.11 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  54.79 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  53.14 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  53.14 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  53.14 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  56.47 
 
 		 306 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  54.52 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  55.23 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  55.23 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  52.12 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  54.07 
 
 		 310 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  55.52 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  55.74 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  52.96 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  54.09 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  50.66 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  51.15 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  53.79 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  51.48 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  51.15 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  51.48 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  51.48 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  55.6 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  59.25 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  53.06 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  53.24 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  54.51 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  54.51 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  45.48 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  55.07 
 
 		 306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  49.03 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  48.67 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  54.25 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  54.08 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  49.18 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.57 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  48 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  48 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  48.33 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  46.92 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.78 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  48.52 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  50.85 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.55 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.9 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  39.32 
 
 		 435 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.84 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 447 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  35 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>