More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4346 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  100 
 
 		 311 aa  584  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  59.21 
 
 		 310 aa  328  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  56.31 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  56.13 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.51 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  40.07 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  41.96 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  40 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  42.11 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  40 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  46.44 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  43.16 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  42.38 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  40.61 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.27 
 
 		 425 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  41.57 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  39.84 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  43.14 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  39 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.37 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 219 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  42.45 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 440 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.37 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>