More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3175 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  100 
 
 
306 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  89.22 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  90.2 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  90.2 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  73.2 
 
 
306 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  74.18 
 
 
306 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  72.22 
 
 
306 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  71.24 
 
 
306 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  72.95 
 
 
306 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  67.97 
 
 
307 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  73.11 
 
 
306 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  68.95 
 
 
306 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  70.82 
 
 
305 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  76.14 
 
 
306 aa  374  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  63.93 
 
 
306 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  63.61 
 
 
306 aa  363  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  65.25 
 
 
306 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  64.05 
 
 
306 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  64.05 
 
 
306 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  53.44 
 
 
308 aa  304  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  59.87 
 
 
310 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  57.34 
 
 
305 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  56.07 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  56.07 
 
 
306 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  53.62 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  55.41 
 
 
306 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  53.29 
 
 
309 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  53.29 
 
 
309 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  57.73 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  50.99 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  55.56 
 
 
308 aa  271  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  52.84 
 
 
308 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  52.67 
 
 
326 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  51.16 
 
 
304 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  50.99 
 
 
305 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  45.45 
 
 
310 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  50 
 
 
308 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
306 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
310 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
309 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  48.99 
 
 
308 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  49.66 
 
 
308 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  50.81 
 
 
305 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  54.05 
 
 
306 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  52.13 
 
 
304 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  47.7 
 
 
303 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  53.04 
 
 
306 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  45.3 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  49.67 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  45.7 
 
 
303 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  49.14 
 
 
311 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  49.49 
 
 
306 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  46.91 
 
 
308 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  47.64 
 
 
307 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  39.8 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  43.96 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  49.34 
 
 
308 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.96 
 
 
306 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
313 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.36 
 
 
306 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
308 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  48.68 
 
 
308 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.6 
 
 
306 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
310 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  42.39 
 
 
290 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
308 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  46.93 
 
 
313 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.33 
 
 
314 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  40 
 
 
308 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  40.4 
 
 
314 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  43.23 
 
 
311 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  39.8 
 
 
313 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
314 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
308 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
314 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  42.54 
 
 
311 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  41.45 
 
 
313 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
312 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  41.94 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.67 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  39.39 
 
 
313 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  37.35 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  40.4 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
320 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 
315 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  44.2 
 
 
314 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  38.74 
 
 
315 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
305 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
307 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.66 
 
 
311 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  37.1 
 
 
311 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
309 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
346 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
310 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>