More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0767 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  100 
 
 		 319 aa  634    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  45.75 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  38.92 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.54 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  38.85 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 290 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  37.7 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  35.81 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.67 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  37.22 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  38.21 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  36.71 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  36.39 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.94 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  35.31 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 447 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 319 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 		 425 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  37.46 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 440 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  33.54 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  33.23 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>