More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1003 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 306 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  97.71 
 
 		 306 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  97.71 
 
 		 306 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  89.22 
 
 		 306 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  71.9 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  73.86 
 
 		 306 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  69.93 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  69.61 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  71.24 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  71.92 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  69.61 
 
 		 306 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  72.13 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  66.23 
 
 		 306 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  70.16 
 
 		 305 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  65.9 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  76.47 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  66.01 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  66.01 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  65.9 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  56.07 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  58.28 
 
 		 310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  57.57 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  55.48 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  57.57 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 306 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  56.25 
 
 		 306 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  51.64 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  56.01 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  55.52 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  52.01 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  51.32 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  51.17 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  50.33 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  48.85 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  48.52 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  54.07 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  46.56 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 305 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  51 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  51 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  48.32 
 
 		 305 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  40.79 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  48.18 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  48.06 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  50 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.73 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.07 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  38.16 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.81 
 
 		 425 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>