More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0137 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  100 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  52.84 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  51.2 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  46.78 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  46.78 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  47.52 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  47.71 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  48.64 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  47.87 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  47.62 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  48.81 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  47.62 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.93 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  46.38 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  46.38 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  46.74 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  49.15 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  46.56 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  43.83 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  46.43 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 425 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.72 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  45.29 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.69 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  45.19 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.05 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  35.8 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  35.87 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  36.77 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  35.87 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>