More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1509 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 306 aa  594  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  77.45 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  75.82 
 
 		 306 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  62.42 
 
 		 306 aa  351  8e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  66.01 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  49.2 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  52.72 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  46.75 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  48.95 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  46.47 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  46.67 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  48.25 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  48.25 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  47.9 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  47.52 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 308 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  43.61 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  45.55 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  50.85 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  47.28 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  43.29 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 314 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  45.9 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  44.59 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  42.33 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  44.07 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  43.67 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.25 
 
 		 314 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  48.05 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  45.19 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  45.19 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  42.19 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  42.71 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.69 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  41.73 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  50.46 
 
 		 219 aa  179  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 346 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  37.63 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>