More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4622 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  100 
 
 		 308 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  67.43 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  65.26 
 
 		 308 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  64.94 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  69.06 
 
 		 306 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  69.06 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1115  inner-membrane translocator  69.38 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5656  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  66.23 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1358  ABC transporter, permease protein  63.31 
 
 		 306 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0272  inner-membrane translocator  63.95 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  60.91 
 
 		 307 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1167  inner-membrane translocator  64.6 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1370  ABC transporter, inner membrane subunit  63.96 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164625  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5241  inner-membrane translocator  63.64 
 
 		 308 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0767  inner-membrane translocator  63.05 
 
 		 305 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0432903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0838  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  37.33 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.86 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  34 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  36.61 
 
 		 308 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  37.33 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  36.99 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  32.67 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  34.35 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  32.88 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.34 
 
 		 425 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 447 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  32.55 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>