More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2766 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  48.09 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  48.36 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  45.36 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  48.22 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  42.76 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  41.64 
 
 		 425 aa  235  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  44.66 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.71 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  43.55 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 425 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 313 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  40 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  40 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 440 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.1 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 447 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  40 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  40.4 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  41.95 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  39.1 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.43 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  43.36 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  37.01 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.83 
 
 		 444 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 445 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.17 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 321 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>