More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3630 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  100 
 
 
306 aa  590  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  94.77 
 
 
306 aa  544  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  94.12 
 
 
306 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  79.14 
 
 
304 aa  427  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  74.83 
 
 
305 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  72.88 
 
 
306 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  71.9 
 
 
306 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  70.26 
 
 
306 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  62.17 
 
 
304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  62.37 
 
 
308 aa  318  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  57.52 
 
 
306 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  55.7 
 
 
308 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  57.84 
 
 
306 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  61.44 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  57.62 
 
 
306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  59.59 
 
 
306 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  59.93 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  59.59 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  59.15 
 
 
305 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  52.46 
 
 
310 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  60.78 
 
 
308 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  54.64 
 
 
308 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  56.91 
 
 
308 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  56.16 
 
 
306 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  55.14 
 
 
306 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  61.44 
 
 
308 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  55.96 
 
 
308 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  55.56 
 
 
309 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  55.96 
 
 
326 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  54.97 
 
 
308 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  56.38 
 
 
310 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  54.97 
 
 
309 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
309 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  56.52 
 
 
306 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  53.92 
 
 
308 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  54.93 
 
 
306 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  53.59 
 
 
310 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  49.35 
 
 
310 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  54.25 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  53.29 
 
 
306 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  53.29 
 
 
306 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  56.45 
 
 
306 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  57.38 
 
 
310 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  57.38 
 
 
310 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
307 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  59.48 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  61.11 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  56.12 
 
 
306 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  57.44 
 
 
306 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  47.46 
 
 
309 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  56.47 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  57.44 
 
 
306 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  57.44 
 
 
306 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  56.75 
 
 
306 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
305 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  49.15 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  47.1 
 
 
308 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  54.64 
 
 
306 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  51.69 
 
 
307 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  49.01 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  49.83 
 
 
303 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  53.42 
 
 
296 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.26 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  43.93 
 
 
306 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
313 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  45.78 
 
 
306 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  42.72 
 
 
311 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  43.32 
 
 
306 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.13 
 
 
313 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  42.07 
 
 
311 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.39 
 
 
314 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.18 
 
 
311 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
308 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  43.54 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
312 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
308 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  40.72 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
327 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
425 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  39.35 
 
 
310 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  38.78 
 
 
310 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
346 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  37.1 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0429  inner-membrane translocator  41.98 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.335933  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  40.59 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  38.52 
 
 
307 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  37.71 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
310 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.48 
 
 
321 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
322 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
322 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  42.47 
 
 
310 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.48 
 
 
314 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.76 
 
 
314 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>