More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1355 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  100 
 
 
310 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  57.1 
 
 
308 aa  338  9e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  60.6 
 
 
306 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  59.26 
 
 
306 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  60 
 
 
306 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  58.33 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  58.67 
 
 
306 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  58.33 
 
 
306 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  59.6 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  57.14 
 
 
306 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  57 
 
 
308 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  57.1 
 
 
305 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  59.52 
 
 
306 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  58.19 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  58.19 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  52.43 
 
 
310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  55.63 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  58.39 
 
 
326 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  58.63 
 
 
308 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  61.61 
 
 
308 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  55.56 
 
 
306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  59.67 
 
 
306 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  54.07 
 
 
309 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 
306 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  56.03 
 
 
308 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  54.07 
 
 
309 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  57.33 
 
 
308 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  54.07 
 
 
309 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  57 
 
 
309 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  53.59 
 
 
306 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  58.84 
 
 
306 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  60.61 
 
 
305 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  58.84 
 
 
306 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  58.84 
 
 
306 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  60.75 
 
 
306 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  59.86 
 
 
306 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.74 
 
 
310 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  56.54 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  55.88 
 
 
306 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  50.49 
 
 
304 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  54.43 
 
 
306 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  50.32 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  50.81 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  53.11 
 
 
304 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  47.44 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  51.14 
 
 
305 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  49.18 
 
 
310 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  50.51 
 
 
303 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  50.51 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  45.19 
 
 
306 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  43.64 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  48.54 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  46.86 
 
 
305 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  51.28 
 
 
308 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
311 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  50.16 
 
 
310 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  50.16 
 
 
310 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  52.27 
 
 
308 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
313 aa  221  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  50.96 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  46.86 
 
 
307 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.6 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  51.6 
 
 
308 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  46.62 
 
 
290 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  50 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
313 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  40.32 
 
 
311 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
311 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
308 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  46.1 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  39.31 
 
 
310 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
309 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  38.44 
 
 
311 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.48 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.74 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
312 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  38.21 
 
 
308 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
319 aa  168  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  39.72 
 
 
310 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
307 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
309 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  40.22 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  38.66 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  37.62 
 
 
314 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.64 
 
 
306 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.38 
 
 
321 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  40.81 
 
 
306 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  36.1 
 
 
308 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  37.91 
 
 
313 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
311 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1115  inner-membrane translocator  40.59 
 
 
306 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250731  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
314 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
310 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  37.32 
 
 
315 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  37.64 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>