More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1793 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 290 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 310 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  43.73 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.07 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  46.77 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  46.45 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  42.26 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  43.81 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  41.42 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.52 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  44.56 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  43.39 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  43.73 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.24 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.87 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 313 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  43.29 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  43.29 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.49 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  37.18 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>