More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3164 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  82.68 
 
 		 306 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  79.08 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  76.8 
 
 		 306 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  81.51 
 
 		 306 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  76.14 
 
 		 306 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  77.45 
 
 		 306 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  78.62 
 
 		 306 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  78.62 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  69.89 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  72.76 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  69.89 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  69.89 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  63.07 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  68.1 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  62.75 
 
 		 306 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  61.76 
 
 		 306 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  61.76 
 
 		 306 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  62.09 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  55.63 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  53.09 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  51.32 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  50.66 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  52.27 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  47.8 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50.17 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  50.34 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  51.7 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  50.17 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  50.17 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  49.83 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  52.04 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  52.04 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  51.33 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  51.33 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  52.56 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  49.18 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  42.21 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  46.82 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  50.67 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  43 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  43.8 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  48 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.04 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  40.26 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.42 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  45.08 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.83 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  51.89 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36.53 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 321 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>