More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3306 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  75.48 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  75.48 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  74.84 
 
 		 314 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  68.47 
 
 		 313 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  77.07 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  65.57 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  62.54 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  61.59 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  61.9 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  61.98 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  63.24 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  62.42 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 305 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  60.95 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  59.29 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0934  inner-membrane translocator  63.17 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.509235  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  38.34 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.67 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  38.02 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4145  inner-membrane translocator  43 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  34.57 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.57 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 313 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  33.89 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  33.44 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  38.19 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 445 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  35.92 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.12 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  32.34 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 440 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  32 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.79 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>