More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1549 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  98.11 
 
 		 317 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  69 
 
 		 310 aa  401  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  52.05 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  53.31 
 
 		 319 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  53.31 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  52.32 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  51.99 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  51.1 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  53.36 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  50.46 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  44.77 
 
 		 318 aa  258  8e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  45.02 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  45.57 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  45.65 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  43.46 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  43.81 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  43.85 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  42.04 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.99 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  36.86 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 319 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.69 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.48 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  36.93 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  36.94 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  32.82 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 301 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.65 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 426 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 426 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  36.27 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 435 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.4 
 
 		 394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 430 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  31.82 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  33.65 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>