More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0810 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  95.77 
 
 		 426 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  100 
 
 		 426 aa  819    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  53.13 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  50.73 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  47.81 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  48.8 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  53.64 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  55.21 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  51.59 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  51.21 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0785  inner-membrane translocator  54.96 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  47.18 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  48.06 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  48.66 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  44.66 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  45.16 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 445 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  44.85 
 
 		 309 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  44.83 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  45.96 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  45.34 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  45.34 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 319 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 307 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 309 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  42.9 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  42.95 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  43.63 
 
 		 319 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  40.73 
 
 		 318 aa  209  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  42.32 
 
 		 321 aa  203  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 284 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 284 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  41.81 
 
 		 318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  38.78 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 303 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 323 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  41.01 
 
 		 317 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 312 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 321 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 316 aa  186  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.38 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 309 aa  183  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 310 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 313 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 322 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  40.13 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  38.67 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 293 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 		 310 aa  170  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 		 317 aa  170  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 310 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.29 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 317 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 309 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.71 
 
 		 305 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 314 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  38.59 
 
 		 314 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>