More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  100 
 
 		 444 aa  861    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  54.85 
 
 		 425 aa  428  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  52.74 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  45.56 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  56.87 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  48.7 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  47.24 
 
 		 435 aa  310  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  51.21 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  52 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  49.7 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 430 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  52.25 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  52.73 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0785  inner-membrane translocator  43.03 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 312 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 306 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 346 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 305 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 310 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 300 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  40.06 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  40.06 
 
 		 319 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 319 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 319 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 		 319 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 		 319 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 319 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 319 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.25 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 		 319 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.44 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  40.6 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 319 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 321 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 303 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 286 aa  177  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 310 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 322 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.76 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.49 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 284 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 284 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 335 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 322 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  33.97 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  36.99 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  35.6 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  33.23 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 310 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.62 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3178  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 351 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.686294  normal  0.1496 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 303 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  31.11 
 
 		 309 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 315 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 306 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  37.7 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  32.48 
 
 		 318 aa  147  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 324 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 293 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>