More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1355 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  100 
 
 		 430 aa  832    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  53.13 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  51.97 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 447 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  51.63 
 
 		 440 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  44.91 
 
 		 425 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  53.17 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  51.74 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  51.84 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  48.4 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  51.23 
 
 		 435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0785  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  34.79 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 346 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 319 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 319 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  42.53 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 309 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 305 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  42.21 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 319 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 300 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  42.37 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.63 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.1 
 
 		 318 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 319 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  40.26 
 
 		 318 aa  206  9e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 307 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 319 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 319 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 303 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 286 aa  200  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  38.29 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.14 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 314 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.56 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.48 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 323 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 301 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  34.87 
 
 		 318 aa  180  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  37.66 
 
 		 318 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  36.72 
 
 		 323 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  40.39 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  36.22 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  35.76 
 
 		 317 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 317 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 314 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.22 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 288 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.24 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>