More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1609 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  100 
 
 
318 aa  625  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  69.4 
 
 
318 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  65.41 
 
 
318 aa  428  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  63.84 
 
 
318 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  65.41 
 
 
317 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  55.35 
 
 
319 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  54.72 
 
 
319 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  53.46 
 
 
319 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  53.14 
 
 
319 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  52.83 
 
 
319 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  52.52 
 
 
319 aa  330  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  52.52 
 
 
319 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 
319 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 
319 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  51.57 
 
 
319 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  50.94 
 
 
319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  51.64 
 
 
344 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  43.46 
 
 
317 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  40.82 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
310 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  40.92 
 
 
307 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
317 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  42.67 
 
 
307 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  40.24 
 
 
319 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  40.24 
 
 
319 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  42.14 
 
 
319 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.21 
 
 
308 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  38.96 
 
 
311 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
309 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
305 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
309 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  37.9 
 
 
286 aa  206  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  42.26 
 
 
316 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.31 
 
 
321 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  36.17 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  40.25 
 
 
321 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
321 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.29 
 
 
312 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36 
 
 
322 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.37 
 
 
321 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.87 
 
 
323 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  37.04 
 
 
309 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
284 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
284 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
321 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
306 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
312 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  38.25 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
425 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  34.64 
 
 
323 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
308 aa  185  7e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
293 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
321 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.38 
 
 
425 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
300 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  38.33 
 
 
288 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
321 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
322 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
288 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
301 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  39.03 
 
 
426 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
325 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  39.1 
 
 
426 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
346 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
310 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
440 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.65 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.91 
 
 
447 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
429 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  34.26 
 
 
319 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
314 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
445 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  38.3 
 
 
420 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
430 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  35 
 
 
319 aa  160  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  33.97 
 
 
444 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
310 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
313 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
293 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
293 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
305 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
292 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  32.72 
 
 
324 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
435 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
335 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
428 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
430 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
311 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>