More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0156 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 292 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  75.17 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  68.06 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  67.71 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  67.93 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  68.17 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  72.03 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  38.64 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 425 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.58 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  38.54 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  38.54 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.51 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  38.59 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  38.14 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 445 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  39.31 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  35 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  35.64 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  34.08 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.37 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.03 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  35 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 429 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 426 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 430 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.11 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 435 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 421 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  36.42 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 420 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 420 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  31.48 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>