More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2116 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  59.8 
 
 
309 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  54.29 
 
 
322 aa  349  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
315 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
303 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
308 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  39.86 
 
 
307 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.54 
 
 
306 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
307 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
286 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.09 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
276 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
325 aa  165  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
309 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.25 
 
 
445 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
314 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
300 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.49 
 
 
321 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
311 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
312 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
346 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
310 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
321 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
319 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  36.11 
 
 
310 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
319 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.95 
 
 
321 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
319 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
299 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  33.11 
 
 
321 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
319 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.69 
 
 
321 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
298 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  32.28 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
319 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
301 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  31.9 
 
 
309 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
319 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
319 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  32.28 
 
 
319 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
319 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 
319 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
319 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.8 
 
 
303 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.86 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  32.87 
 
 
319 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
306 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
288 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.18 
 
 
425 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
322 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2124  inner-membrane translocator  37.75 
 
 
305 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
323 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
321 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  31.77 
 
 
425 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
323 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
319 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
308 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  32.75 
 
 
430 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  32.34 
 
 
344 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
303 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
303 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.66 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.54 
 
 
310 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  31.92 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.32 
 
 
318 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  32 
 
 
435 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  32.45 
 
 
318 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  32.18 
 
 
323 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.92 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.8 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  30.18 
 
 
444 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  30.66 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  31.01 
 
 
335 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  29.21 
 
 
440 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  31.74 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  31.43 
 
 
420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  31.8 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  29.87 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  30.47 
 
 
428 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
306 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>