More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4444 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  100 
 
 		 298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  94.72 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  94.72 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.42 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.72 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0907  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.086185  normal  0.263875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.02 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  34.57 
 
 		 435 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.37 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 445 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  37 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.49 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 429 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  36.46 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  30.07 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  34.27 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  33.78 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 420 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  29.7 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  28.19 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  31.27 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>