More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0007 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 303 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 303 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  94.22 
 
 		 298 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  34 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0907  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.086185  normal  0.263875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36.68 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.02 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.42 
 
 		 435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.62 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  37.18 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.22 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  31.08 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  34.95 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  35.03 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.67 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  32.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  28.92 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  30.77 
 
 		 444 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>