More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5246 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  100 
 
 		 305 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  35.14 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.82 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.92 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  39.16 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  38.89 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.31 
 
 		 435 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  37.83 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.81 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  34.95 
 
 		 344 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.07 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  38.49 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 440 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  35.92 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 319 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 430 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  35.6 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.74 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 430 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 435 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 429 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  36.48 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>