More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 425 aa  811    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  57.31 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  56.97 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  61.08 
 
 		 429 aa  411  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  53.95 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  59.47 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  55.47 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  52.94 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  56.73 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  56.36 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 426 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 346 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0785  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 309 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 309 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  44.03 
 
 		 305 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 300 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  43.88 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 319 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  41.35 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  41.35 
 
 		 319 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 		 319 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 319 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 319 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  41.22 
 
 		 344 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 319 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 320 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 323 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.49 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.43 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.86 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  40.39 
 
 		 317 aa  189  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 310 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  38.75 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  37.38 
 
 		 318 aa  183  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  37.38 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 310 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 305 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  38.76 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 314 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  35.96 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.17 
 
 		 314 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 		 309 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 315 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 303 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 313 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 317 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 313 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>