More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3178 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3178  inner-membrane translocator  100 
 
 		 351 aa  674    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.686294  normal  0.1496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1414  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 350 aa  232  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.381128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 319 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  34.94 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.94 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  35.22 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 425 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  38.19 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.6 
 
 		 425 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  36.98 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  34.85 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.24 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 321 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 306 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  32.03 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 440 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.26 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 307 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.57 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  33.23 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.47 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 430 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  38.49 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 305 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  35.29 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.69 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 429 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  38.16 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 426 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  36.13 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.1 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  34 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  36 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>