More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1414 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1414  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  673    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.381128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3178  inner-membrane translocator  43.93 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.686294  normal  0.1496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 300 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  36.48 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  34.29 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 445 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.29 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.11 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  33.23 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  34.33 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 293 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  30.13 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  33.77 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  36.56 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.32 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 		 425 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.64 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.77 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 284 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 284 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  31.78 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  33.22 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 426 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  30.64 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  32 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 421 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>