More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3538 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3538  inner-membrane translocator  100 
 
 		 432 aa  845    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  59.11 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  57.32 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  55.5 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  49.77 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  51.04 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4400  inner-membrane translocator  54.92 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 307 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.25 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  31.17 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  30.98 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 319 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 319 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 286 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  30.16 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.25 
 
 		 318 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  29.12 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 293 aa  156  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 346 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  37.59 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  28.18 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.73 
 
 		 323 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 307 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  31 
 
 		 318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  32.31 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  32.09 
 
 		 317 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 323 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.87 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  29.16 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  30.18 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  29.4 
 
 		 317 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 304 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  32.03 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 313 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 315 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.96 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.58 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  28.61 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 307 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>