More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4400 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4400  inner-membrane translocator  100 
 
 		 425 aa  799    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  62.37 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  60.76 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  54.52 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  56.74 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  54.41 
 
 		 420 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  53.87 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3538  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  30.95 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  36.15 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 301 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  38.16 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  38.16 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 303 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 293 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 300 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.75 
 
 		 318 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  37.91 
 
 		 344 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 310 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 317 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.63 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.36 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 286 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 321 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.95 
 
 		 425 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.3 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  29.6 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  31.38 
 
 		 318 aa  136  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  34.32 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  28.27 
 
 		 317 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 288 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  30 
 
 		 319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 304 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.06 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 312 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 313 aa  126  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  29.4 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.84 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>