99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0223 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  100 
 
 		 380 aa  765    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  63.95 
 
 		 380 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  66.32 
 
 		 380 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  63.16 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  30.88 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.98 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  36.94 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  30.75 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  35.98 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  32.24 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  29.72 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  35.67 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  34.05 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  38 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  27.02 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  32.81 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  32.5 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  29.88 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  24.74 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  28.22 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  31.32 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  27.91 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  29.7 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.07 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  23.04 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  24.07 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.93 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  21.41 
 
 		 584 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 498 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  24.62 
 
 		 567 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  25.36 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  25.61 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  26.29 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  22.35 
 
 		 492 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  26.98 
 
 		 506 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.2 
 
 		 505 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  23.51 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  24.54 
 
 		 499 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  26.94 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25.39 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 507 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25.39 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.37 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.52 
 
 		 575 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.52 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  30 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  23.5 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  26.46 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  26.26 
 
 		 508 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  47  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  30 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  30 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 502 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  26.64 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  23.56 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.27 
 
 		 482 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  29.41 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  23.56 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.19 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  24.1 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  27.87 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  23.17 
 
 		 559 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  28.42 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  24.88 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  29.9 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  26.04 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  26.04 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  26.63 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  28.42 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  27.45 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  33.87 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  26.7 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.02 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  25.17 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.54 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  26.98 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  23.56 
 
 		 573 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  23.6 
 
 		 228 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 480 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  26.48 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  26.54 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25.27 
 
 		 562 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.07 
 
 		 570 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4652  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.87 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  32.26 
 
 		 498 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  24.73 
 
 		 574 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  28.21 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  27.62 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  35.56 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  26.61 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>