31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0978 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  100 
 
 		 357 aa  715    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  73.31 
 
 		 345 aa  531  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  74.04 
 
 		 341 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  74.84 
 
 		 161 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  38.46 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  39.51 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  39.24 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  37.76 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0450  hypothetical protein  70.34 
 
 		 118 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  32.5 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  30.1 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  28.26 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  28.28 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  28.5 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  27.51 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  27.88 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  26.8 
 
 		 164 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  25.25 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  25.65 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  26.54 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  25.51 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  24.18 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  27.84 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  26.18 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  25.13 
 
 		 457 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  30.85 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  24.74 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  38.78 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  25.38 
 
 		 453 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>