112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2148 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  100 
 
 		 380 aa  770    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  63.95 
 
 		 380 aa  524  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  63.16 
 
 		 380 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  63.95 
 
 		 380 aa  511  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  27.87 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  29.19 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  29.55 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  30.55 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  34.97 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  28.34 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  35.11 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  34.57 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  28.62 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  30.81 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  32.24 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  28.33 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  30.06 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  35.86 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  30 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  27.32 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  28.87 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  28.5 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.88 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  23.88 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  22.17 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  28.5 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  22.11 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  22.36 
 
 		 507 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  22.64 
 
 		 574 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  26.26 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  30.85 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  25.38 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 501 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  34.02 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  27 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  24.43 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  28.29 
 
 		 161 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  26.13 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  22.99 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  22.47 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.6 
 
 		 499 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  23.81 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 		 505 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  23.9 
 
 		 289 aa  49.7  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  26.11 
 
 		 478 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  23.4 
 
 		 584 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  26 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.28 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  26.84 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  26.49 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  25.73 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.6 
 
 		 570 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  22.47 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  23.53 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  23.93 
 
 		 550 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  25.23 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  31.96 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  23.43 
 
 		 559 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 500 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.26 
 
 		 569 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.43 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  25.67 
 
 		 497 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  22.22 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  24.52 
 
 		 565 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 		 504 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.26 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  26.34 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  32.88 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  26.2 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30.99 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  33.8 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  23.69 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  25.41 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  34.55 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  33.87 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  22.11 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  32.39 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  30.68 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  25.76 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.18 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.73 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.24 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  29.55 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  24.34 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  30.99 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 560 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  25.74 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  21.24 
 
 		 567 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>