194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0048 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  46.77 
 
 
247 aa  222  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  40.68 
 
 
228 aa  201  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  41.2 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  40.91 
 
 
236 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  39.66 
 
 
231 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  33.77 
 
 
266 aa  125  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  29.58 
 
 
259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  31.93 
 
 
402 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  33.05 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  31.34 
 
 
506 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.95 
 
 
514 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  29.71 
 
 
344 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.71 
 
 
519 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  30.93 
 
 
520 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  31.97 
 
 
250 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  30.25 
 
 
519 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.57 
 
 
565 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 
507 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 
507 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  28.87 
 
 
519 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  29.49 
 
 
482 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.43 
 
 
584 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 
362 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  31.36 
 
 
521 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  31.36 
 
 
521 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.79 
 
 
512 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  31.36 
 
 
575 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  31.36 
 
 
575 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  27.5 
 
 
509 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  28.39 
 
 
509 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.55 
 
 
510 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.04 
 
 
510 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.92 
 
 
498 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  31.3 
 
 
562 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.45 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.45 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30 
 
 
570 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.79 
 
 
512 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  29.74 
 
 
497 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  31.76 
 
 
478 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  29.79 
 
 
535 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  29.24 
 
 
514 aa  99.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  30.93 
 
 
562 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.44 
 
 
505 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.5 
 
 
509 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  28.94 
 
 
488 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  30 
 
 
570 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  28.39 
 
 
512 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  27.97 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.58 
 
 
459 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  29.44 
 
 
506 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  28.27 
 
 
574 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  29.73 
 
 
500 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 
509 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.08 
 
 
567 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  28.87 
 
 
528 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  30.3 
 
 
560 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  29 
 
 
563 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  29.75 
 
 
280 aa  95.5  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  29.82 
 
 
500 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  30.64 
 
 
492 aa  95.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  29.31 
 
 
575 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
520 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 
520 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  30.38 
 
 
499 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  30.74 
 
 
505 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.64 
 
 
504 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  28.39 
 
 
569 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
498 aa  92.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 
504 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  29.34 
 
 
285 aa  92  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  30.54 
 
 
281 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  27.2 
 
 
550 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.66 
 
 
498 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  31.12 
 
 
364 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.18 
 
 
573 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.94 
 
 
508 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  28.33 
 
 
494 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  28.38 
 
 
505 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  26.47 
 
 
232 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 
502 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
489 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  29.63 
 
 
283 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
507 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  26.42 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0716  KaiC  30.18 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  29.29 
 
 
293 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  28.4 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  27 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
497 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
503 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 
496 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  27.16 
 
 
494 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
503 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  27.07 
 
 
574 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 
501 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  25.96 
 
 
496 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>