13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1787 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  89.04 
 
 
360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  67.98 
 
 
378 aa  309  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  51.95 
 
 
362 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  48.21 
 
 
373 aa  191  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  28.33 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  31.15 
 
 
380 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  26.94 
 
 
380 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  28.57 
 
 
380 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  38.33 
 
 
574 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  28.26 
 
 
453 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  28.26 
 
 
453 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  29.58 
 
 
450 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>