82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1347 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  100 
 
 		 373 aa  742    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  55.06 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  54.65 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  50.99 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1787  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  67.01 
 
 		 143 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  31.32 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  30.77 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  30.57 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  27.37 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  31.97 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  27.72 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  28.26 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  27.32 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  25 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  25.99 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  26.41 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  23.34 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.83 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  27.44 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.24 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.26 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  30.69 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.01 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 		 574 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.11 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  26.26 
 
 		 510 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.37 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  27.17 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  27.54 
 
 		 570 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  27.16 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.42 
 
 		 584 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  25.09 
 
 		 565 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  28.1 
 
 		 575 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.1 
 
 		 575 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.72 
 
 		 575 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  26.6 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.55 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 504 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  25.29 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.37 
 
 		 498 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  26.59 
 
 		 514 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  25.35 
 
 		 164 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  25.45 
 
 		 505 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  27.74 
 
 		 567 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  25.87 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  25.9 
 
 		 569 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  26.06 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.09 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  27.72 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  25.87 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.9 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  24.88 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  24.54 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25.09 
 
 		 489 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  25.43 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  25.09 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  24.73 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 		 496 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  30.34 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  26.62 
 
 		 562 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  25.64 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.83 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.51 
 
 		 532 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  38 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  24.18 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  24.16 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.58 
 
 		 474 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  26.16 
 
 		 504 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 504 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 497 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  25.9 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.54 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  22.99 
 
 		 559 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  26.92 
 
 		 462 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>