30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0406 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  100 
 
 		 335 aa  683    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  57.66 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  51.65 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  52.29 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  39.51 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  37.74 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  40.18 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  52.83 
 
 		 161 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  33.88 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  34.05 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  34.05 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  32.24 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  32.95 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  34.29 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  31.79 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  28.5 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  30.22 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  31.58 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  30.94 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  27.07 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  26.04 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  27.22 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  29.75 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  27.07 
 
 		 451 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  22.93 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  26.83 
 
 		 458 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  27 
 
 		 441 aa  42.7  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 921 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>