34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1669 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  100 
 
 
341 aa  684    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  74.04 
 
 
357 aa  527  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  71.47 
 
 
345 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  79.87 
 
 
161 aa  276  4e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  39.06 
 
 
333 aa  216  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  40.18 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  38.51 
 
 
334 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1277  AAA ATPase  39.55 
 
 
326 aa  208  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000745853  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0450  hypothetical protein  66.38 
 
 
118 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  30.73 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  32.32 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  32.81 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  29.44 
 
 
411 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  25.56 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  29.65 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  27.32 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  26.25 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  28.87 
 
 
380 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  25.2 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  26.07 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  28.17 
 
 
164 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  28.24 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  29.1 
 
 
454 aa  50.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  27.61 
 
 
394 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  26.34 
 
 
466 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  25.27 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1788  signal transduction ATPase  32.22 
 
 
143 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  25.82 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  26.67 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  25.79 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  25.58 
 
 
457 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  25.68 
 
 
457 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  33.68 
 
 
844 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  25.95 
 
 
475 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>